TrAgLor - Turkish Agricultural Learning Objects Repository

Object Details

A Genetic Linkage Map in Pistacia vera L. x Pistacia atlantica Desf. Population

Identifier : Catalog : URI
Entry : http://traglor.cu.edu.tr/objects/objectFile/1zCMewW8-2982013-47.pdf


Title : Turkish Pistacia vera L. x Pistacia atlantica Desf. Melez Populasyonunda Genetik Haritalama
English A Genetic Linkage Map in Pistacia vera L. x Pistacia atlantica Desf. Population
German Eine Genkopplung Karte in Pistacia vera L. x Pistacia atlantica Desf. Bevölkerung


Language : Turkish Turkish



Descriptions : Turkish Bu çalışma ISSR, SRAP ve AFLP teknikleri kullanılarak antepfıstığının ilk genetik bağlantı haritasını oluşturmak amacıyla yapılmıştır. ‘Siirt’ (Pistacia vera L.) çeşidi ile monoik ‘PA-18’ genotipi (Pistacia atlantica Desf.) arasındaki melezlemeye ait 92 F1 bitkisi ile ‘double pseudo-testcross’ haritalama metodu uygulanarak iki ayrı genetik bağlantı haritası oluşturulmuştur. Çalışmada uygulanan 16 ISSR primerinden açılım gösteren 19 markörün 9’u ‘Siirt’ çeşidinde, 10’u ise ‘PA-18’ genotipinde tespit edilmiştir. Ayrıca uygulanan 27 SRAP primer kombinasyonundan 96 markör açılım göstermiş olup bunların 49 adedi ‘Siirt’ çeşidinde, 47 adedi ‘PA-18’ genotipinde belirlenmiştir. Bununla birlikte, 27 AFLP primer kombinasyonuna ait açılım gösteren 206 markörden ‘Siirt’ çeşidinde ve ‘PA-18’ genotipinde sırasıyla 107 ve 99 markör olarak tespit edilmiştir. Bu çalışmada, ‘Siirt’ çeşidinin haritasına ait toplam 165 markörün (9 ISSR, 49 SRAP, 107 AFLP) %87’si 1:1 ve %13’ü ise 3:1 açılım oranlarına sahip olmuş ve ortalama markör yoğunluğu ise 9.70 olarak belirlenmiştir. Diğer taraftan ‘PA-18’ genotipinin haritasını oluşturan toplam 156 markörden (10 ISSR, 47 SRAP, 99 AFLP) %86’sı ve %14’ü sırasıyla 1:1 ve 3:1 açılım göstermiş olup bunlara ait markör yoğunluğu 8.21 olarak tespit edilmiştir. Bunlarla birlikte, 17 bağlantı grubuna sahip ‘Siirt’ haritası toplam 1237.3 cM uzunluğunda olup iki markör arasındaki ortalama uzaklık ise 7.50 cM olarak hesaplanmıştır. ‘PA-18’ genotipinin haritasını oluşturan 19 bağlantı grubunun toplam uzunluğu ise 1337.5 cM ve markörler arası ortalama uzaklık ise 8.57 cM olarak saptanmıştır. Sonuç olarak bu çalışmada antepfıstığının moleküler ıslaha geçiş için temel oluşturacak ilk genetik bağlantı haritası oluşturulmuştur. Gelecekte antepfıstığında yapılacak haritalama çalışmalarında daha fazla genom içeriğine sahip olmak ve daha yüksek yoğunluklu doymuş genetik haritalar elde etmek için daha fazla sayıda bitki analiz edilmeli ve daha fazla sayıda açılım gösteren dominant markörler ile birlikte SSR gibi kodominant markörler kullanılmalıdır.
Turkish This study was carried out to construct the first genetic linkage map of pistachio using ISSR, SRAP and AFLP molecular marker techniques. Two separate genetic linkage maps have been constructed by applying the strategy of ‘double pseudo-testcross’ mapping with 92 F1 hybrid individuals of a cross progeny which were derived from crossing between ‘Siirt’ (Pistacia vera L.) cultivar and monoecious ‘PA-18’ (Pistacia atlantica Desf.) genotype. In this research, 19 markers segregated by analysing 16 ISSR primers, 9 of which were identified in ‘Siirt’ cultivar and 10 in ‘PA-18’ genotype. Besides, from 27 SRAP primer combinations, 96 markers segregated, 49 of which were identified in ‘Siirt’ cultivar, and 47 belonged to ‘PA-18’ genotype. In addition to these, 206 markers segregated from 27 AFLP primer combinations, of which were identified in the ‘Siirt’ cultivar and in the ‘PA-18’ genotype as 107 and 99 markers, respectively. In accordance with this study, a total of 165 markers (9 ISSRs, 49 SRAPs, 107 AFLPs) belonged to the map of ‘Siirt’ cultivar, of which 87% 1:1 and 13% 3:1 segregated with an average marker number of 9.70. Besides this, in the map of ‘PA-18’ genotype, of 156 markers (10 ISSRs, 47 SRAPs, 99 AFLPs) with a mean marker number of 8.21, 86% and 14% found to have 1:1 and 3:1 segregation, respectively. In this study, ‘Siirt’ genetic map had 17 linkage groups spannig 1237.3 cM length with a mean marker density of 7.50 cM and ‘PA-18’ genetic map comprised 19 linkage groups covering 1337.5 cM with a mean marker density of 8.57 cM. This study has the first basis of genetic linkage maps of pistachio for molecular breeding. In the future mapping studies, more hybrid progenies should be analyzed and more dominant markers should be used together with co-dominant markers like SSR to obtain better genome coverage for a better saturated high density maps.
German Diese Studie wurde durchgeführt, um die erste Genkopplung Karte Pistazie mit ISSR, SRAP und AFLP-Molekulare Marker-Techniken zu konstruieren. Zwei separate Genkopplung Karten sind gebaut worden, durch die Anwendung der Strategie der 'doppelten Pseudo Testcross' Zuordnung 92 F1 Hybride Einzelpersonen ein Kreuz nachkommen, die Kreuzung zwischen 'Siirt' (Pistacia Vera L.) Sorte und einhäusig 'PA-18' (Pistacia Atlantica Desf.) Genotyp abgeleitet wurden. In dieser Forschung 19 Marker getrennt durch Analyse 16 ISSR Zündkapseln, 9 davon wurden in 'Siirt' Sorte und 10 in "PA-18" Genotyp identifiziert. Außerdem aus 27 SRAP Grundierung Kombinationen, 96 Marker getrennt, 49 davon wurden in 'Siirt' Sorte, und 47 gehörte "PA-18" Genotyp. Zusätzlich zu diesen getrennt 206 Marker aus 27 AFLP-Primer-Kombinationen, von denen in der Sorte 'Siirt' und der 'PA-18'-Genotyp bzw. als 107 und 99 Marker identifiziert wurden. Gemäß dieser Studie gehörten insgesamt 165 Marker (9 ISSRs, 49 SRAPs, 107 AFLPs) die Karte von 'Siirt' Sorte, davon 87 % 1:1 und 13 %: 3:1 mit einer durchschnittlichen Marker-Anzahl von 9,70 getrennt. Darüber hinaus in der Karte des 'PA-18'-Genotyps, 156 Marker (10 ISSRs, 47 SRAPs, 99 AFLPs) mit einer mittleren Marker-Reihe von 8.21, gefunden Sie 86 % und 14 %, die 1:1 und 3:1 Segregation, beziehungsweise. In dieser Studie 'Siirt' genetischen Karte hatte 17 Linkage Gruppen Spannig 1237,3 cM lang, mit einer mittleren Marker-Dichte von 7,50 cM, und "PA-18" genetischen Karte umfasste 19 Linkage-Gruppen über 1337,5 cM mit einer mittleren Marker-Dichte von 8,57 cM. Diese Studie ist die erste Grundlage für Genkopplung Karten von Pistazien für Molekulare Zucht. In der Zukunft mapping Studien, sollten weitere Hybrid-Progenies analysiert werden und dominanter Marker sollte zusammen mit mitherrschenden Marker wie SSR verwendet werden, um bessere Genom-Abdeckung für eine bessere gesättigten high-Density Maps zu erhalten.


Keywords : Turkish antepfıstığı
English pistachio
German Pistazie
Latin Pistacia
Turkish genetik haritalama
English genetic mapping
German genetische Zuordnung
English AFLP
English SRAP
English ISSR


Coverage : World


Structure : Atomic


Aggregation Level : Level 2


Version : Turkish Adana, 2010


Status : Final


Contribute : Role : Author
Date : 2010-01-19
name : Yüşa Türkeli
e-mail :
organization : Çukurova Üniversitesi Fen Bilimleri Enstitüsü Bahçe Bitkileri Anabilim Dalı, Adana – Turkey




Identifier : Catalog : URI
Entry : http://traglor.cu.edu.tr/common/object_xml.aspx?id=1415


Contribute : Role : Undefined
Date : 2013-08-29
name :
e-mail :
organization :


Metadata Schema : TrAgLor LOM AP


Language : Turkish Turkish
Format : Text


Requirements : Operating System: Multios
Min ver :
Max ver :
Browser: Any
Min ver :
Max ver :


Installation Remarks :


Other Platform Requirements :


Duration : Year : 0 Month : 0 Day : 0 Hour : 0 Minutes : 0


Size : 1070946 bytes


Location : http://traglor.cu.edu.tr/objects/objectFile/1zCMewW8-2982013-47.pdf


Interactivity Type : Expositive


Learning Resource Type : Thesis


Interactivity Level : Very Low


Semantic Density : High


Intended End User Role : Learner


Context : University Postgraduate


Typical Age Range : English 18U


Difficulty Level : Very Difficult


Duration : Year : 0 Month : 0 Day : 0 Hour : 0 Minutes : 0


Description :


Cost : No


Copyright and Other Restrictions : Yes


Description : This resource is licensed under the license(CC-BY-NC-ND) Creative Commons Attribution-NonCommercial-NoDerivs 3.0 Unported


Kind : IsVersionOf


Resource : Catalog : URI
Entry : http://library.cu.edu.tr/tezler/7677.pdf


Description : Turkish Çukurova Üniversitesi Kütüphanesi Tez Koleksiyonu


Entity : name :
e-mail :
organization :


Date :


Description :


Purpose : Discipline


Source : English AGRICOLA


Entry : Plant Breeding and Genetics


Description :


Keywords : Turkish bitki ıslahı
English plant breeding
Turkish moleküler genetik
English molecular genetics